Европейская хартия местного самоуправления провозглашает: местные органы власти должны иметь возможность сами определять свои внутренние административные структуры, которые они намерены создать, с тем чтобы те отвечали местным потребностям и обеспечивали эффективное управление (ст. 6).
Конституция Российской Федерации (ст. 3), закрепляя механизм осуществления принадлежащей народу власти: самим народом непосредственно, а также через органы государственной власти и органы местного самоуправления, подчеркивает тем самым особое значение органов местного самоуправления как отдельного, самостоятельного уровня в системе народовластия, как одну из основ конституционного строя Российской Федерации. Конституция Российской Федерации также содержит указания на то, что органы местного самоуправления не входят в систему органов государственной власти (ст. 12) и их структура определяется населением самостоятельно (ст. 131).
Федеральный закон от 6 октября 2003 г. № 131-ФЭ ограничивает случаи участия органов государственной власти и их должностных лиц в осуществлении исполнительно-распорядительных и контрольных полномочий, в формировании органов муниципальных образований, назначении и освобождении от должности должностных лиц местного самоуправления (ст. 5, 6, 34, 37, 75). Закон не допускает подчиненность органа или должностного лица одного муниципального образования органу или должностному лицу местного самоуправления другого муниципального образования (ст. 17).
В советский период местные органы власти выступали как звенья единой системы органов государственной власти, построенной на основе принципов строгой подотчетности нижестоящих органов вышестоящим, руководства вышестоящих органов нижестоящими органами. И хотя данная система взаимоотношений органов власти формально допускала самостоятельность местных органов в решении вопросов местной жизни, в действительности она исключала эту самостоятельность в силу жесткой централизации и концентрации государственной власти, бюрократизации ее аппарата;