Предмет, задачи и цели науки муниципального права, ее специфические функции определяют методологию науки, которую в общем виде можно определить как совокупность приемов и способов исследования выражения и закрепления научного знания, составляющего предмет науки.

Методология науки муниципального права основывается на диалектическом методе познания, в соответствии с которым развитие местного самоуправления и отдельных муниципально-правовых институтов рассматривается в полном соответствии с такими «фундаментальными закономерностями, как единство и борьба противоположностей, переход количественных изменений в качественные, отрицание отрицания и т.д.». Кроме этого, диалектико-материали-стический метод познания предполагает всесторонний, объективный анализ как местного самоуправления в целом, так и отдельных муниципально-правовых институтов, в частности, через взаимосвязи субъектов права, единство количественных и качественных характеристик, логического и конкретно-исторического подходов и т.п.

Наука муниципального права использует присущие всему отечественному государствоведению научные методы исследований. Один из этих методов — метод системного анализа, позволяющий рассматривать местное самоуправление, с одной стороны, в качестве одной из форм политической системы общества в России, с другой стороны, как целостную систему организации власти народа в городах, сельских поселениях и на других территориях, состоящую из элементов (формы непосредственной демократии, органы местного самоуправления, территориальное общественное самоуправление), посредством которых население осуществляет свое конституционное право.

Данный метод позволяет правильно определить структуру исследования отдельных проблем муниципального права, выявить наиболее существенные принципы организации местного самоуправления, характер взаимоотношений между органами государственной власти и органами местного самоуправления, глубже понять механизмы воздействия права на общественные отношения, связанные с деятельностью населения муниципальных образований по решению вопросов местного значения, охватить все объективно необходимые и взаимосвязанные функции органов местного самоуправления, для реализации которых они наделяются соответствующими полномочиями.